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            降解檢材無法通過STR進行DNA鑒定?可以用SNP檢測!

            • admin
            • 2020-04-27 10:41:10
            • 文章來源:未知
            • 點擊次數:

                  STR和SNP都是一種DNA檢測方法,親子鑒定就是STR分型檢測方法的應用,無創產前親子鑒定就是SNP分型檢測方法。親子鑒定的第一步就是檢測出樣本的DNA數據,原后才能分析兩者間的親子關系。因此對于樣本的檢測是很重要的,如果樣本不合格或是含留樣者的DNA檢測較少,檢測不到樣本的DNA信息,后面的分析親子關系就沒法進行。所有做親子鑒定對樣本都有一定的要求,當然兩者DNA檢測方法是不是可以同時使用呢?一般在做親子鑒定上是不可以的。因為兩者檢測的費用和成本是不一樣的。且親子鑒定對樣本的量是有要求的,其親子鑒定行業檢測也是有標準的。如果用于親子鑒定STR分型的方法檢測不到,而用SNP的方法能檢測出,也是需要補樣本重新進行STR分型檢測,但是在刑事案件中就不一樣了,案件現場采集的樣本有限的時候,降解檢材無法通過STR進行DNA鑒定?可以用SNP檢測!

                  目前,STR基因座已被廣泛應用于案件鑒定的個體識別以及DNA數據庫建立,但當犯罪現場提取的物證為降解檢材時,僅通過STR基因座信息可能無法實現個體識別。此時SNP分型結果可作為應用于個體識別的補充鑒定,也就是說,通過將案發現場收集到的法醫物證檢材與嫌疑人的SNP遺傳標記進行比對,判斷前后兩次或多次出現的個體是否為同一個體,作為補充個體識別鑒定的一種補充方案。
                  隨著單倍型圖的產生,SNP也日益受到關注。SNP是英文“single nucleotide polymorphism”的縮寫,意為單核苷酸多態性或單堿基多型性,指基因組內特定的核苷酸位置上存在有兩個不同的堿基,故又稱為二等位基因標記(Bi-allelic markers)。
                  基因組序列差異有很多種,如堿基插入、缺失、SNP以及微衛星等,SNP僅是其中最常見的一種。雖然單個SNP位點在多態信息含量、個體識別能力及非父排除率等方面鑒別能力有限,但結合目前各種新技術手段的應用,可以使人們通過高通量測序獲取大量的SNP信息來體現SNP的鑒別優勢。同時,因其分布廣泛、突變率低、擴增片段短等特點,使其在法醫學領域有著廣闊的應用前景。

                  法醫學中SNP的優勢有哪些呢?
                  第一,數量多、分布廣、突變率非常低,在父權鑒定中更為有利。
                  據估計,人類基因組中每1000個核苷酸就有1個SNP,人體30億堿基對中共有300萬以上的SNPs,通常情況下,這300萬個不同的堿基被稱為人類的SNP數目。SNP是由個人的遺傳背景來決定的,且可作為具有臨床意義的診斷標志物,很多發達國家也因此投入了大量的人力與財力進行SNP解析,努力建成本民族的SNP數據庫,使得SNP技術在法醫學中逐步展現了它的優勢。

                  第二,易于分型及確定基因頻率,適用于混合樣品的分析。
                  SNP大都表現為二等位基因標記,由于SNP的二態性,等位基因頻率容易估計,對SNP進行基因分型包括三方面的內容:
                  1、鑒別基因型所采用的化學反應,常用的技術手段包括:DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應、側翼探針切割反應以及基于這些方法的變通技術;
                  2、完成這些化學反應所采用的模式,包括液相反應、固相支持物上進行的反應以及二者皆有的反應;
                  3、當化學反應結束后,應用生物技術系統來檢測反應結果。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略,該策略的原理是首先選擇參考樣本制作標準曲線,然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較,根據所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。 

                   第三,適合高通量技術分析。
                  能夠在日常工作中建立有效的數據庫。近幾年,通過全基因組關聯分析在全基因組上掃描大量的SNP,分析不同表型組間基因的差異闡述基因和表型之間的關系,發現了能提供個體表型信息的SNP位點,包括身高、膚色、虹膜和毛發顏色、種族或地域來源等。
                  由于個體黑色素的含量與分布不同,使得不同種族以及地區人群的皮膚、頭發及眼睛的顏色差異很大。黑色素的形成過程及其轉移與提取等過程會涉及大量的基因,有學者研究構建由10個SNP組成的預測皮膚顏色的體系,并證實這個體系對東亞人群,尤其是中國的漢族群體皮膚顏色有預測價值。
                  面部特征表型遵循孟德爾遺傳規律的某些特征表型信息,如多毛耳、酒窩、美人尖及雀斑等是可以預測的,并在酒窩及雀斑等特征表型進行遺傳變異的檢測時,無論是同卵雙生子還是異卵雙生子,特征表型具有遺傳性。
                 有研究表明,伴有或不伴有腭裂的非綜合征性唇裂與一些SNP相關。Fan等對下頜前突表型的人群進行遺傳學研究發現,EPB41基因內SNP(rs4654388)的等位基因C與該表型極其相關。
                  2012年,Liu等對歐洲人的研究發現,運用三維增強核磁共振的技術手段,分析5個SNP與不同臉型特征有關,同時也發現與先天顱面異常的基因NSCL/P,也與鼻子和臉龐寬度之間存在關聯??梢娐摵嫌跋窦夹g與遺傳學方法對人類面部形態進行預測特征表型信息可作為潛在的有力手段之一。

                  近年來已有的許多報道表明,特征表型信息SNP的遺傳變異已被應用于傳統DNA遺傳標記所不能解決的案件中,特別是對特征表型信息的刻畫上,作為STR的輔助手段,在刻畫表型特征上具有非常大的優勢。當STR系統的分型結果不足以作為某些復雜親緣關系或個體識別的確定時,SNP可以作為補充鑒定的遺傳標記。X染色體、Y染色體和線粒體SNP可在某些特殊的親緣關系鑒定中作為補充鑒定的遺傳標記使用。
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